新聞| | PChome| 登入
2003-08-28 21:58:32| 人氣166| 回應0 | 上一篇 | 下一篇

光合基因組定序

推薦 0 收藏 0 轉貼0 訂閱站台

科學家解開了第一個海洋細菌--藍綠細菌的基因組序列碼,它可能是光合作用生物所需的最小基因組。

藍綠細菌是海洋中最常見的細菌,他們負責了海洋中將近一半的光合作用,並且佔全球總量的四分之一。他們每年從空氣中移除約一百億噸的碳。

基因組定序小組成員聖地雅哥加州大學的Brian Palenik表示它的基因組將有助於我們瞭解整個生態系統,他也指出,以往的細菌定序主要是病源菌,而這次是首次有了全球生態上非常重要的生物之基因組。

然而若要研究微生物對環境的廣泛影響,基因組定序的領導人麻省理工學院的Sallie Chisholm認為我們也還需要瞭解不同物種和品系在海洋中的分佈,因此多樣性的輿圖也同樣是重要的。

被定序的Prochlorococcus marinus是地球上最大量的光合細胞,一毫升的海水中就含有超過一百萬個。它最常見於熱帶和溫帶的海洋,在兩極則較少見。一個地中海的品系的基因組只有一百七十萬個鹼基,大約有1700個基因。而另一個由法國國家科學研究中心的Frederick Partensky等人定序的馬尾藻海品系則有類似大小的基因組。相對的,綠藻Chlamydomonas則比它多了五十倍的DNA。

Prochlorococcus可能缺乏能面對環境變化的基因,或許是它不需要,因為海洋最穩定的居所,也有可能是它們負擔不起,因為海洋的營養成份不豐富。

而另一個被定序的物種Synechococcus,則有較大的基因組,約為二百四十萬個鹼基和2500個基因。它的數量則較少,約一毫升含有一萬個細胞,但它卻較比Prochlorococcus分佈更廣。

Synechococcus的基因組顯示它有比Prochlorococcus有更廣大範圍的生化功能,有些酵素能夠協助它們保存海洋中短少的鐵質,並能通過不多來源利用氮。它的基因組中也被找到一個細菌中最大的蛋白質,可能與其游動能力有關。

原學術論文:
1) Rocap, G. et al. Genome divergence in two Prochlorococcus ecotypes reflects oceanic niche differentiation. Nature, published online, doi:10.1038/nature01947 (2003).
2) Dufresne, A. et al. Genome sequence of the cyanobacterium Prochlorococcus marinus SS120, a nearly minimal oxyphototrophic genome. Proceedings of the National Academy of Sciences, published online, doi:10.1073/pnas.1733211100, (2003).
3) Palenik, B. et al. The genome of a motile marine Synechococcus. Nature, published online, doi:10.1038/nature01943 (2003).


--參考來源:

EurekAlert! (08/13/2003) -- Scripps team part of collaboration that reveals first ecological genomic 'blueprints'
http://scrippsnews.ucsd.edu/article_detail.cfm?article_num=586

Nature Science Update (08/14/2003) -- First ocean bacteria sequenced
http://www.nature.com/nsu/030811/030811-6.html

EurekAlert! (08/13/2003) -- Genomes of tiny microbes yield clues to global climate change
http://www.eurekalert.org/pub_releases/2003-08/dgi-got081303.php

--相關連結:
Prochlorococcus Genome
http://spider.jgi-psf.org/JGI_microbial/html/prochlorococcus/prochlo_pickastrain.html

Prochlorococcus Genome
http://www.sb-roscoff.fr/Phyto/ProSS120/

Synechococcus Genome
http://www.jgi.doe.gov/JGI_microbial/html/synechococcus/synech_homepage.html

上圖為Prochlorococcus的穿透式電子顯微鏡照片,下圖為Synechococcus的穿透式電子顯微鏡照片。上圖摘自http://www.microbialgenome.org/primer/analysis.html,下圖摘自參考來源一。


本文原刊登於SciScape:
http://www.sciscape.org/news_detail.php?news_id=1247

台長: Gene Ng@UC Davis
人氣(166) | 回應(0)| 推薦 (0)| 收藏 (0)| 轉寄
全站分類: 社會萬象(時事、政論、公益、八卦、社會、宗教、超自然)

是 (若未登入"個人新聞台帳號"則看不到回覆唷!)
* 請輸入識別碼:
請輸入圖片中算式的結果(可能為0) 
(有*為必填)
TOP
詳全文