H1N1新流感步莫拉克風災後塵肆虐台灣，一如對水患的救災無力，馬統政府在防疫作戰再次表現無能與欺瞞。相較於阿扁任內為ＳＡＲＳ數度召開國安會，阿九的防疫反應不僅只是慢半拍，看他面對災情的顢頇與徬徨，似乎背後有隻黑手在操控，而主謀就是中國。
新流感籠罩台灣，人心惶惶，民進黨主席蔡英文批評，馬英九與劉兆玄一通電話就決定不開「國安會議」，非常草率與不負責任。民進黨要求馬政府要負起責任，做好防疫措施、有所作為。
出席防疫會議的前衛生署疾病管制局局長蘇益仁呼籲，啟動國安機制，有總統令為依據，步調才會快，否則很多公務員根本不敢有動作，而且最好停止年底選舉或延後選舉。
蘇益仁說，美國總統歐巴瑪花費六百億美元大量買疫苗，估計十月大流行時，至少五十％的美國民眾可以接種疫苗；為什麼台灣的總統不願意站出來？
政府說我們有足夠的藥物，實情卻是，藥物只有十三％至十八％人口量的克流感，其中十％是原料藥，三％是第二線用藥，要用噴或吸的，五％是藥材，一般人所認定的藥只有○．五％，還是二○○三年時採購的；其他來源則是國光製造的疫苗，三個月的黃金準備期已過。
前高雄市衛生局長陳永興也重砲批評，馬政府未積極準備H1N1疫苗，又未進口疫苗，最快十月下旬才能開始施打疫苗，為時太晚，而屆時國光疫苗能否通過人體試驗仍屬未知。
新型流感疫情有擴大跡象，有學者推估國內可能約七千人死亡。不過，被稱為「國內冠狀病毒之父」的成功大學校長賴明詔呼籲，新型流感的毒性不像ＳＡＲＳ，且學者估計國內數千人死亡是「可能的最壞情況」，不是必然會發生，國人勿過度恐慌。
至於政府訂定的「三二五停課標準」（高中以下學校、幼稚園、補習班，三天內同一班有二名以上學生診斷為流感時，該班就要停課五天），賴明詔認為「太嚴格」。
賴明詔指出，目前台灣的新型流感疫情已進入社區感染，再怎麼隔離仍會擴散，若按此標準，開學後可能會引發大規模停課，造成更大恐慌，付出的社會成本太高。即使是美國，目前也沒有訂定如此嚴格的停課標準，他建議放寬停課標準，如果班上有重症個案，才需要立即停課。
賴明詔分析，根據美國媒體報導，美國每年死於一般性流感約三萬人，估計死於新型流感約有三萬至九萬人，都只是可能性。就像美國在一九七八年曾發生豬流感疫情，花了數億美元去製造疫苗，最後死於施打疫苗的人數，竟然比死於豬流感的人數還多。
南部災區縣市除新流感疫情蠢蠢欲動，還有傳染病虎視眈眈。高雄縣衛生局長黃志中指出，目前政府公布「三二五」停課政策，建議停課天數為五天，不符合各國最少停課七天標準，恐造成防疫漏洞。
為有效防堵疫情，高縣內除將實施學校、補習班及幼教機關定期監測體溫，並將要求各醫療院所通報二十歲以下類流感病例，另將根據健保局提供的流感診斷資料，兩項資料交叉比對，盼能有效防止疫情擴散。
高雄縣長楊秋興表示，由於收容中心災民大多打地鋪、群聚生活，最容易相互感染，近日天氣好，鼓勵災民日曬棉被，稍緩流行性傳染病的發生。屏東林邊、佳冬同為災區，淤泥尚未清除，為避免疫情擴散，衛生局必要時啟動高高屏區域防疫網，共同防疫。
民進黨籍立委邱議瑩八月二十六日質疑，國安會秘書長蘇起是不是就是背後的影武者？「之前拒絕外援，現在如果防疫專家也是蘇起，罪加一等，蘇起應該下地獄！」
邱議瑩批評，「還要死多少人，馬才願意啟動機制？還是要得到中國大陸的許可？是不是要等到火燒屁股了才要啟動？到底要死多少人？！」
邱議瑩說，「不知道台灣人民還要受到什麼樣的教訓才能讓政府真正的覺醒？」她批評，馬英九說小林村民得到教訓，「但是馬英九得到教訓了嗎？防疫要提前讓人民做好準備，明知道會大量死亡跟流行，為何不願意提前作準備？」
前行政院長謝長廷二十六日下午在廣播節目中指出，召開「國家安全會議」對於馬英九而言沒有壞處，可集中權力做更有效的預防工作，也可讓民眾對疫情更有警覺心。
他說，馬英九也許是考慮到臺北聽奧即將開幕，聽奧又是他與台北市長郝龍斌的重要政績，如果因H1N1疫情召開「國安會議」啟動防疫機制，聽障奧運怎辦得起來？
他建議，台北市政府應審慎評估是否繼續舉辦聽奧，因為屆時國外的選手、教練都到台灣，有擴大感染之虞，這些都須審慎評估。
衛生署長楊志良看了政論節目名嘴的發言，竟氣得向媒體喊話，強調依《傳染病防治法》第六十三條「散布有關傳染病流行疫情之謠言」，最高可處五十萬罰鍰。
中國黨團下會期書記長呂學樟則痛批楊志良「太白目」，甚至說重話，指楊展現出「專業的傲慢」。同黨立委羅淑蕾也痛批說，政務官盡量不要對外做情緒化發言，已經夠亂了，與疫情防治、如何控制無關的發言，都盡量不要發言；嗆媒體的發言也可以不要，無助改善疫情與穩定民心。
從來都「不沾鍋」的馬英九又想再找一個「余文」來當替死鬼，阿九保住了自己的政治生命，卻犧牲了無數台灣人民的寶貴性命！
防疫、救災如同作戰，八八災難發生一周後，阿九才在各方責難下召開國安會議，現在防疫則推托說專家建議不開國安會議，真不知道是專家在當總統還是阿九當總統？不過，有個疑問值得探討，為何馬英九對於國安會議那樣敏感？自己身為台灣民選總統，對於國家安全事項竟然如此輕忽漠視，難道要不要召開國安會議？竟真如邱議瑩所說：要中國的許可嗎？
連要不要開國安會議都得看中國臉色的馬統政府，其實，擺明了就是將台灣定位為中國的一省，「中華民國」都已經「滅國」了，還開甚麼「國安會」！
