總統大選結果揭曉，主攻「拼經濟」的國民黨總統、副總統候選人馬英九 、蕭萬長，昨以765萬8724票、58.45%的得票率，大勝民進黨候選人謝長廷、蘇貞昌221萬3485票，當選中華民國第十二任總統、副總統。長昌配得到544萬5239票，得票率41.55%，和馬蕭配勝負差距達16.9%。
馬蕭得票數超越2004年扁呂配的647萬1970票，得票率比1996年李登輝、連戰的54%還高，創總統民選史新高。馬蕭的超高得票不只讓國民黨奪回失去八年的執政權，二次政黨輪替成功，也宣告「馬英九時代」來臨。
馬允諾用人不分黨派
馬英九昨晚7時25分在競選總部前數千名支持者吶喊「總統好」聲浪中，宣布勝選，他發表「從感恩出發、從謙卑做起」演說，強調「這是全體台灣人民的勝利。」他表示，選舉結束是承擔的開始，也是改革的開始。
馬英九表示，立委選舉，國民黨拿到超過三分之二多數，總統大選又過半，「這代表人民支持我們完全執政、完全負責的看法，我們會以最快速度把人民的付託變成政策和施政。」他也向長昌及其競選團隊、支持者致意，表示從不敢忽視民進黨過去對台灣民主、進步的貢獻。他並允諾執政後會納入謝長廷部分政見為施政參考，用人會一視同仁、不分黨派。
馬英九在勝選後記者會說，選舉結果出爐後，他與謝長廷已通過電話，馬轉述，謝要求支持者不要去抗爭，而且表達可接受馬的領導，對此，馬肯定謝「展現出一個政治家的風範！」
在馬對支持者發表演說的同時，謝長廷在台灣維新館旁發表一席感人的敗選感言。他先帶領競選團隊向群眾深深一鞠躬，承認敗選事實，並恭喜馬蕭當選。他說，他很遺憾民進黨這次表現不如預期，辜負人民的期待，他應負最大責任。
謝長廷呼籲支持者冷靜面對結果，不要再有抗爭，讓社會迅速修補因為選舉的裂痕，讓人民能很快地生活在愛與信任的環境裡。他向支持者喊話，大家還有更重要的任務，「就是祖先留下來的民主的火種不能熄滅。」他強調，「選舉是我個人的失敗，不是台灣的失敗，今天不要為我哭泣，聚集我們的力量繼續熱愛台灣。」
藍營落淚：終於贏了
面對謝長廷慘敗，總統府僅透過新聞稿恭賀馬蕭，並對長昌表達肯定與慰勉。扁重申五二○之前將全力維持政局安定，順利完成政權交接。
這場激烈的藍綠對決，雙方支持者都神經緊繃。昨下午3時，藍營支持者開始在馬總部外集結，臉上貼著國旗、手拿駿馬標語、頭綁馬頭巾。4時開票後，隨著馬英九得票數一路領先，支持者情緒不斷升高，5點59分，當馬得票過半時，現場汽笛、戰鼓齊鳴，支持者忘情高喊：「馬總統！馬總統！」
晚上7時30分，馬英九上台宣布當選，現場煙火齊放，汽笛聲不斷，許多忍耐了八年的藍軍支持者仰望著下著細雨的天空，吶喊：「這就是變天啦！」有人更喜極而泣，激動地說：「終於贏了！終於贏了！」
相對於藍營的亢奮，下午4時投票結束，長昌支持者緊盯電視螢幕，看到馬英九票數節節升高，臉色愈發凝重，不少人眼眶泛紅，期待逆轉，但隨著票數拉大，許多人開始眼淚不停掉下，不斷呢喃：「完了！完了！」
據中選會統計，這次大選全國選舉人共1732萬1622人，投票人數1322萬1609人，投票率76.33%，略遜上兩屆總統大選八成、八成二。無效票為11萬7646張，比率佔0.89%。
綠只守住南部5縣市
在全台25縣市中，馬英九拿下綠營執政的高雄市、台南市以及整個北台灣、中彰投、花東外島共20縣市。綠色執政7縣市中，長昌只拿下雲林縣、嘉義縣、台南縣、高雄縣、屏東縣5個縣市。與大選併辦的兩公投案，投票率僅三成五，均未通過。
美國總統布希昨在第一時間恭喜馬英九當選，他說這給中國和台灣一個「全新的機會」和平地弭平兩岸差異，「台灣再一次展現民主的力量和活力，我恭喜馬英九勝選。」
中國國務院台灣事務辦公室發言人李維一昨晚表示，「陳水扁當局推動的所謂以台灣名義加入聯合國的公投遭到失敗，再次說明台獨分裂勢力搞台獨是不得人心的。」他並表示，「兩岸關係和平發展是兩岸同胞的共同願望。」
對於馬蕭勝選，東海大學政治系教授傅恆德指出，扁政府執政八年造成大環境不好是最大的主因；此外，延續國民黨贏得立委選舉的氣勢，民眾也受西瓜效應影響，將票投給馬。東華原住民族學院院長施正鋒認為，選舉結果可看出，「選民對民進黨的不滿，遠大於對國民黨的討厭」，民進黨過去幾年的負面形象，讓支持者不願出來。
民眾看二次政黨輪替
民進黨太差
贏200萬票不夠啦，因為民進黨太差了。
欣賞馬正直
贏200萬票是理所當然的，民進黨的選舉手法太爛了，馬英九他正直，謝長廷只會抹黑沒有政
唾棄扁政府
陳水扁執政8年弊案不斷，不管是他自己或是他的家人都有貪污的問題，人們當然會唾棄政府。
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