阿愷認為本代劇情方面改變相當大 不但雨傘公司倒閉了 病毒也改成寄生蟲與邪教徒......以下劇情轉載自巴哈姆特討論區:
生化危機4劇情概略：
1998年，浣熊市爆發了生化危機，而美國政府爲了不讓危機蔓延，與使用核彈摧毀了浣熊市，並搗毀了罪惡的源頭，umbrella傘公司。而我們的主角leon正是那次危機的幸存者之一（說到這，不知大家都看生化危機：啓示錄沒有，和這段劇情還是拍得很像的）一切似乎恢復了平靜。就這樣，6年過去了。我們的leon也從當時警察局剛報道的新丁，一下成爲直屬美國總統調配的秘密特工（6年從巡警變頂級特工，佩服一個）
2004年的某月，總統的女兒ashley(20歲，未婚，被國內超有名”ucg”等多家媒體評選爲近年Miss President´s daugter第一名）在放學途中被一夥不知身份的恐怖分子綁架了，經過美國情報部門的調查，發現ashley被綁到了歐洲某個國家的一個小村子裏，於是總統爲了防止女兒被淩辱然後撕票(編按:......)，一邊拖住綁匪，一邊派出了自己手下的秘密武器leon去解救第一美女。於是，在2004年的秋天，我們的故事在歐洲某部落展開了......
（遊戲開始）
leon得到當地警察部門的合作和當地的兩名警察大叔一同前往情報來源的小村子，途中兩個操著濃重法語腔英語的警察大叔（連警服都很像法國的）似乎很不懈leon的solo misson，認爲美國總統簡直是瘋了。而leon似乎也很輕鬆。途中一個警察還隨地小便，殊不知有人已經開始準備行動了！過了一個小木橋，警察大叔把車停到橋邊，讓leon自己進去調查，他們在這裏等！ leon說why?他們說怕有parking ticket（倒）。於是leon自己進了村子，打算打聽一下村民ashley的下落（我想用槍打警察大叔的腦袋，可遊戲就是不讓，鬱悶）這時，一個漂亮眼鏡妹妹和leon取得了聯繫，說是他的backup,leon也狂妄的說不管是誰綁架的總統女兒，他都找錯物件了！
進到眼前的一座小木屋，裏邊有一個兇神惡煞的男人正在生火，leon 剛想打探兩句，誰知男人極不友好的嚷嚷起來了，leon只好作罷，剛想走，誰知男人拿起斧頭朝leon劈來，leon避開後叫他不許動，可他好像瘋了一樣還是猛劈過來，leon無奈，只好把他幹掉了（阿彌陀佛）！leon看看窗外，自己已經被狂暴的村民包圍了，這時一輛爆走的哢嚓突然沖向警察大叔的車，一聲巨響，估計凶多吉少了。leon不禁說了句shit!眼鏡妹妹告訴leon查到ashley北關在前方不遠的一個教堂裏，於是leon便起身前往了。
一路上真是困難重重，麻煩多多，無數狂暴的村民蜂擁而來，雖然他們稱得上是有意識，但卻是完全被殘暴化了。leon只好殺出一條血路，難道這又是一次生化危機？經過市集，發現其中一個警察大叔被村民們吊起來活活燒死了.（leon心想誰讓你當初不跟著我呢）繼續向前經過一片墓地到了教堂，可是們卻怎末也打不開，無奈只好到別處尋找開門的途徑。走到一個小木屋，聽到儲物箱中有動靜，打開一看，原來是一個長髮男，撕開長髮男的封嘴膠布，沒說兩句話兩人就讓人打暈了......昏昏沈沈中，leon感覺有人在他脖子的大動脈中打了一針，種下了一個種子......醒來後，發現和長髮男綁在了一起，兩人寒暄之後，互相介紹，原來長髮男叫LUIS,似乎也是進入這個村子的特工，leon告訴他自己是6年前生化危機的幸存者，luis對leon 産生了興趣，就在這時，一個光頭大鬍子巨人進來了，一斧子砍下去，兩人順勢弄斷了手銬，leon拳打腳踢顯然不是他的對手，於是luis把他引跑了......出門後遇到了武器商人，終於可以強化裝備了！^_^繼續向前途中被一個大湖給攔住了，用望遠鏡看到湖中央一條快艇上，兩個村民把另外一個警察的屍體扔到了湖中，leon終於第二次說出了shit!^_^村民把船駛到了岸邊，於是leon準備渡船到對岸，誰知到湖中央出現了巨型水獸，leon一不小心把錨刮倒了巨獸的身上，於是小艇開始了狂奔，好在小船上有漁槍，把水獸搞定了，leon來到對岸的小屋裏，忽然一陣劇痛，leon口中吐出了一大灘血，然後身上的血管都爆了起來，似乎要獸化....leon大叫起來。好在只是一場夢，leon醒了過來，但天已經黑了，還下起了瓢潑大雨。拿到教堂鑰匙，往回返。這時村民們被爆頭後腦袋會變成一條大蟲，似乎一切的起因就是這個東西......途中遇到一個巨人怪獸,好不容易砍死他背上的大蟲。回到教堂，又見到了光頭大鬍子，正跟一個巫師模樣的人談話，還告訴leon終究會變成他們的一員的......在教堂裏終於見到了ashley------
ashley:滾開！！！討厭！怪物！流氓！色狼！壞人！
leon:.............我是受美國總統下達的命令前來就你的！
ashley:(馬上笑容展開）什麽？我爹？太好了！於是兩人開始了逃脫行動！！
和眼鏡妹妹聯繫，他告訴leon會派直升機來接他們，叫他們去匯合點，但半路又告訴 leon敵人把直升機打下來了！（俗）叫他們先去前邊的一個教會城堡等新的支援。於是leon一路上艱難的保護著ashley爲他掃平了所有障礙，舉步維艱的前進，經過一段木橋後他們終於被村民包圍了，無路可走，只好先沖到眼前的小屋，原來luis也在這裏。luis:“世界真小！”把門鎖了個嚴嚴實實，leon叫ashley躲起來，自己和Luis合作，應付眼前的惡仗！村民們從的窗戶蜂擁而入，經過一番苦戰終於打退了村民，而村民似乎是聽到了鐘聲，然後就散開了（早知道就隨身帶個鍾嗎，最強終極武器：座鐘）繼續前進，第三次見到了長鬍子光頭男，而且終於怪物化，打倒他後，取下他的右眼，開了大門，終於到了教會城堡，但在裏面等著他們的似乎是更兇猛的教徒......
躲過教徒們們猛烈的炮火，喘歇之際，luis又來了，並告訴leon他拿到了病毒的樣本，然後問ashley是不是也被種下了種子，ashley又會想起了一幕幕被玩弄的畫面，無奈的點了點頭，正興高采烈之際，luis發現樣本丟了，於是決定再返回去找，leon欄他，但他卻執意要去，leon問他爲什麽爲別人拼命，luis表示了事情成這樣和自己有很大關係......
進到城堡內部，迎接他們的是一個囂張的小矮子，小矮子勸leon還是把ashley交出來，這不是扯的嗎，小矮子說那就走著瞧吧......兩人突破重重包圍，共同解決不少迷題後，走到城邦中央時，ashley突然覺得身體不適，leon問他又沒有問題，誰知他叫leon不要碰它，說著就拼命跑，終於掉入了陷阱，被一個機關弄到了牆的後面，leon束手無策只好再去找線索來救ashley......在一個大庭院裏，收到了小矮子的信號，他把眼鏡妹妹的信號給切斷了，也就是說現在等不到支援了，那就一切靠自己吧，小矮子告訴leon這是嘎花園迷宮，有時候自己都出不去（靠，真白吃，我一會就出去了）在迷宮裏受盡瘋狗的撕咬後終於拿到了可以到達ashley機關房間的紋章，剛要離開花園，突然遭到一個紅一女子的襲擊，（我們期盼多年的女人終於回來啦，記得當初真爲他倆那段訣別哭過）一針較量之後...
女子摘下了墨鏡：leon,好久不見！
leon:......ada,看來你真的是爲wesker工作.這時，ada的墨鏡發出一陣白煙。。。
小心點，leon！ada消失了......[這段情節讓我很失望:( .. ]
來到了機關房間的二樓，Luis也來了，高興的告訴leon找到樣本了，突然被一支巨大的蠍子尾巴刺爆頭...噢，原來是被巫師幹掉了，樣本也被順便取走了，leon發誓要爲luis報仇，用狙擊槍，打掉ashley身上的枷鎖，再幹掉撲向他的敵人，終於和leon會合了（這裏有一段操縱ashley逃跑的劇情，是唯一一段可以操縱ashley的地方）就要逃出城堡之際，ashley再次落入小矮子的陷阱，而leon也掉入了城堡的地道裏，而小矮子也派出了自己的左右手之一去殺leon,逃過了追殺，又回到了地面，要面對無窮的大蚊子（整個有戲我最討厭的地方，視點問題找得你暈頭轉向）。回到了城堡，剛要出城堡，一座小矮子的雕像突然動起來，leon拼命的逃，橋被雕像踩爛了，雕像掉進了萬丈深淵到了對面，leon在千鈞一髮之際抓到了對面......這邊，巫師命令一個叫crauser的貝雷帽殺掉leon！
終於和小矮子開始了決鬥，小矮子和巨大的觸手融合，變成了猙獰異常的龐然大物，當然這難不到leon,一針周旋之後小矮子終於去另一個世界了。這時巫師的電波進來了，告訴leon ashley現在在他手裏，在對岸的島上，我們的主角也向最後的目的地建在島上的實驗所基地進發了......
disc 1完
ada坐在小船上正等著leon呢：想乘船嗎？帥哥？
leon:好啊！......ada開著船快到岸的時候，leon剛想和ada增進一下感情，突然ada把船尾一甩，自己用鈎槍鈎住岩壁走了：我還有事要做！l
eon只能無奈：唉，女人哪！！！
leon終於來到了最後的目的地，等待他的卻是更爲強悍的敵人：狂暴化的傭兵。這時的敵人，攻擊力和移動都有了相當程度的提升.....尤其是出現了會使用重機槍的敵人......穿過了層層實驗室，又見到了巫師，他手上就抱著ashley,leon剛要上前，誰知卻動彈不得，巫師聲稱一旦leon體內的種子發作，他就可以控制他，leon眼睜睜的看著ashley被帶走了，不過leon留了個心眼，往ashley身上裝了個發汛器......畫面一轉，這邊crauser和ada正在聊著什麽。
ada:樣本在哪里？
crauser:在XXX(巫師的名字，我忘了）那裏，很安全。 ada剛要轉身走。
crauser:我不信任你們，尤其是wesker.
ada:我認識wesker 可比你時間長多了......
就這樣leon 和crauser相遇了
crauser:好久不見了，戰友！
leon:crauser,原來是你！
crauser:就像我預期的，你成長了不少嘛！兩人開始了進身搏鬥（CQB..嗯，是格鬥術統稱..和MGS3 的CQC分別在於CQC在戶外，而CQB則在室內啦...)crauser占得了先機，眼看到資就要刺下來了，ada一槍打中crauser，救了leon......
ada:你們認識嗎？
leon:哼，老朋友了。
ada:......你最好趕快把你體內的種子拿出來，不然他很快就會控制你的......
這時，leon的backup到了，mike駕駛著戰鬥直升機來了，並幫助leon一同戰鬥（這是遊戲最爽的部分，直升機可以幫你把攻擊你的怪物掃個乾乾淨淨，你只需躲在一邊就可以了）不過沒多久直升機就被狂暴的傭兵打了下來，leon又失去一個同伴，心中的怒火正在點燃！
leon在一堆廢棄的遺迹中和crauser又相遇了。
leon:crauser,你不是死了嗎？
crauser: 你們都以爲我在兩年前的空難中死了，但我又奇迹般的活下來了，並獲得了新生！
leon:原來是你綁架了ashley!
這次可要用武器和crauser較量了，在周旋了好幾個會合後，crauser獸化了，但一樣菜鳥，解決掉他之後，
leon有些惋惜：crauser,你是怎麽了？你之前可是一個好人哪......
就快到最終決戰了，這時leon感到身體不適，ada出現，問leon怎末樣？leon紅著雙眼，突然卡住ada的脖子。ada畢竟是女子，那有leon勁大，情急之下，拿出匕首猛紮在leon腿上，
leon似乎也清醒了：對不起，ada.呼....呼......
ada:看來你要趕快把它弄出來了......
終於見到了巫師，和被關在容器裏的ashley,當leon正要和巫師決一死戰時，ada又出現了，拿槍沖巫師一通掃射，並讓leon趕快救ashley,趁著巫師被ada牽制著leon救下了ashley,兩人從後門逃出去了，這邊，只見巫師血管湧動，剛才中的子彈全被他擠了出來（Terminator?）朝後門追去，ada打爆了門口的油桶，將巫師點燃......
leon和ashley在實驗室分別幫對方將身體內的種子去掉，兩人拼命的跑，在一個升降機前，leon 讓ashley停下，自己上去看看情況。leon上到一片工地，赫然發現ada被調在半空中，剛想去救他，巫師安然無恙的出現了，並最終獸化，變成了大蠍子......
leon最終又是用ada抛來的火箭筒終結了最終boss,隨後ada也又順手用槍指向了leon（6年前經典場面重現）要leon交出病毒樣本---
leon:你要它想幹什麽？
ada: 肯定會比你有用的。
ada跳上了來接她的直升機（不知是誰駕駛？）ada:你放心吧，從你那拿來的，我一定會好好保管的......給你這個。說著扔給leon一個帶著可愛挂飾的鑰匙，拿著它趕快逃吧。然後掏出一個遙控器。
leon:不是吧你（汗）.....
ada啓動了倒數裝置，和leon byebye了（女人真狠！）
下去接上了ashley，告訴他就要爆炸了？ashley差點沒暈過去（一百年的倒楣事都趕上了）兩人拼命逃到了岸邊，跳上了ada準備的快艇，拿出ada的鑰匙，啓動了快艇，開始了最終脫出（這裏有一段操縱快艇的情節，很刺激）最終，兩人趕在了爆炸的一瞬間逃出了小島（玩的就是心跳）......
leon:我們回家吧
ashley:這真是個好主意,任務完全了,對吧?leon
leon:不~還不算,要安全的送妳回家才行
ashley:那回家之後,我們還能再聚一聚嗎?
leon:抱歉~我....
ashley:其實我知道你會拒絕的,但只是問一問也沒什麼吧,對了~那個女人是誰?
leon:為什麼問這個?
ashley:來嘛,告訴我
leon:她是我心中的幻影,我永遠也無法解譯,就這樣吧~
(生化危機4完)片尾字幕中，會交待一些村民狂暴前的安居樂業片斷，和他們被教會宣傳洗腦，捉去做實驗的插畫，完後會有眼鏡妹妹和leon的對話：
Leon：Hunnigan，是你嗎？
Ingrid：通訊終於恢復了......
Leon：嘿~~~！你沒有戴眼鏡耶！！
Ingrid：別管眼鏡了。任務怎樣了？
Leon：已經成功救出目標了。正在返回途中。
Ingrid：幹得好！Leon
Leon：謝了！你知道嗎,你沒戴眼鏡的模樣真的很可愛呢！
我回去後你能給我你的電話號碼嗎？
Ingrid：也許我該提醒你：你還有任務在身！
Leon：唉~~~~~~！
......(劇情完)
文章定位：
