壹、司法機關適用法律的原則：司法機關適用法律，由各級法院為之，不受干涉，但須遵守以下原則：
1. 不告不理：除非有人提出告訴，法院不得對法律爭議逕為裁判。
2. 不得以法律有瑕疵而拒為裁判：民法不明不備，法官要解釋、類推、補充或造法後據以裁判。但刑法不明不備時，須嚴格遵守「罪刑法定主義」，只能依據行為發生時的法律規定，才得以論罪科刑，否則，行為雖然不倫無道，被社會所共同唾棄指責，但仍不得對之施以罪刑。
3. 依法審判，且不得拒絕適用法律：我國各級法院法法官並沒有違憲審查權，對於可能牴觸憲法的法令，法官只能暫停訴訟程序，將該法律聲請大法官解釋，等是否牴觸憲法疑慮澄清後，再依法進行審判，也就是說各級法院法官不可以自己認定法令違憲而拒絕適用。
4. 法庭以外處所不得裁判：法官和法庭是彰顯法律權威公信的兩項要件。只有法官才可以對犯罪者審問和處罰，而法官則必須在法庭內才可以行使審判權。
5. 一事不再理：訴訟案件一經裁判確定，當事人就不得再對同一事件提起訴訟，否則法院定紛止爭的目的，將永遠無法達成。所謂裁判確定，係指當事人不再上訴，或者是裁判已經是最終審級裁判。一事不再理原則的適用，必須滿足以下條件：(1)前後兩案件內容完全一致、(2)需為有效的實體裁判、(3)須為本國法院的判決，換句話說，同一犯罪行為未經有效的實體裁判，當然可以再為審理裁判，或者該犯罪行為發生在外國領域，且雖經外國法院判罪處刑，但仍得再由本國法院審理裁判。此外，如果審判違背法令，當事人可以提起非常上訴。如果發現證物偽變造、證言虛偽誣告，或者發現新證據，則可以提起再審，藉此動搖已經確定的裁判。
貳、行政機關適用法律的原則：行政機關適用法律，受到層層節制，不像司法機關各級法院可以獨立審判，不受干涉。但行政機關仍有以下適用法律原則：
1. 無待請求，主動適用：依法行政，主動適用，無待人民請求。
2. 接受上級指揮監督：下級行政機關對於上級機關之指揮監督，雖然可以陳述意見，但有服從的義務。不過，上級機關命令如果顯然違法，下級機關則無服從的義務，例如：上級命令之行為非屬下級職掌之事項，或命令欠缺法定方式與程序。
3. 適用法律，可以發布命令：法律通常僅規定原則，而未能對所有細節詳細規定，因此各國均允許行政機關在執行法律時，另行頒布命令，以補充執行程序與相關細節。
4. 便宜處分、自由裁量：行政機關可以在法律許可範圍內，就執掌事項自由裁量、便宜處分。
叁、法規範的適用原則1.強行法與任意法的適用原則：法律概有強行法與任意法的區別，強行法事涉公益，不顧私人意思而必須強行適用，憲法、刑法、行政法、訴訟法多為強行法。例如甲殺害乙未遂，乙雖然願意原諒甲，但刑法殺人未遂罪仍應強行適用。至於刑法「告訴乃論」罪刑，如傷害、毀謗、公然侮辱等，則屬任意法，是為強行法的例外。任意法事涉私益，僅在私人間無特別約定時才適用，亦即法律雖有規定，但可以允許當事雙方另為約定，只要雙方無異議，雖然違反該任意法，其行為仍然有效。民法多為任意法，但也有例外。例如民法
第982條：「結婚應以書面為之，有二人以上證人之簽名，並應由雙方當事人向戶政機關為結婚之登記」，就是屬於強行法。
2.實體法與程序法的適用原則：法律另有實體法與程序法之區別。實體法規定權利義務實體關係。如民法、刑法。程序法規定運用及實施權利義務的方式和程序，如民事訴訟法、刑事訴訟法。「實體從舊，程序重新」原則，新法規生效前發生之行為，有關實體上之事項，原則上不適用新法規，而適用行為時有效之法規，稱為「實體從舊」或不溯既往原則。至於程序上之事項，則適用新法規，稱為「程序從新」原則。
3.特別法與普通法的適用原則：所謂普通法，是指適用於全國一般地域、一般人民及一般事項的法律，如：刑法、民法。至於別法，則是指僅適用於特定地域、特定人民或特定事項的法律，如：陸海空軍刑法、性侵害犯罪防治法。對於同一犯罪行為之處罰，應優先適用特別法，當特別法無規定時，始適用普通法，這稱為「特別法優於普通法」原則
