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2013-10-20 08:27:39| 人氣412| 回應0 | 上一篇 | 下一篇

華大基因是世界上最大的基因組測序中心之一!!!

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 華大基因是世界上最大的基因組測序中心之一!!!

 




 

 

它是跨國生技大廠「孟山都」想買下的公司。一群激情的中國科學家,如何在短短十二年間,在全球基因學界,走路有風,建立龐大發言權?它代表著,中國在生物科技版圖中,已佔有一席之地。距離深圳市區一小時車程,來到東部海濱的鹽田區。這裡原本是棄廠離開的台商所開設的舊鞋廠,如今搖身一變成為科技園。華大基因讓舊廠煥發出驚人的生命力。每個月,這裡幾乎能產出一篇文章刊在《自然》或《科學》期刊上。全球生技研究院陸續找他們合作,農業與醫療企業排隊拜訪。連孟山都也想買下這支中國團隊。一群穿著實驗服的年輕人正在培養胚胎,這裡每週可做幾百個胚胎。他們最大的成就,是把胚胎植入養豬廠裡的母豬,每一頭長得一致、基因相同。有「小豬博士」稱號的三十四歲博士杜玉濤,是「手工克隆豬(複製豬)技術」的發明者。她受到華大院長、總裁汪建科學精神的感召,再加上他的一句「把技術(手工克隆)帶回中國吧」,眼看歐美在基因改造的倫理問題上,爭議不斷,杜玉濤決定從丹麥回到家鄉。謙稱自己是「科技民工」,汪建十年間,吸引四千名研究人員跟隨,一○%是海歸派。諾貝爾獎得主,發現DNA雙螺旋結構的詹姆斯.華森,也是華大董事會成員。團隊研究人員平均年齡約二十五歲。華大的二把手是三十五歲的常務院長王俊,首席科學家是二十五歲的李英睿。他們都是頂尖期刊的常勝軍。眼前的汪建,則是讓這群人跟隨的靈魂人物。他瘋狂又充滿激情。在他左前臂有個花生米大小的傷疤,那是他從皮膚上取下細胞做實驗後,留下的疤痕。五十七歲的汪建和他的伙伴,中國科學院院士楊煥明,早期曾在國外求學或工作。汪建曾在華盛頓大學,楊煥明則在哈佛、UCLA進行基因研究。一九九九年,他們爭取代表中國,參與全球人類基因組計劃,為一%的人類基因定序。當時還沒人能預測,中國能在基因科技版圖上,追趕世界那麼快。事實上,當時台灣由榮陽團隊,對人類第四號染色體鹼基定序,也貢獻了千分之三。但台灣政府後續的投入卻相形見絀。近三年,中國政府花費至少兩百億人民幣推動基因研究,使不少台灣海歸也投入對岸陣營。汪建說起話來很霸氣,有點偏執。每回遇到台灣朋友,他總會認真揶揄台灣,「台灣的心態都不到,只想用別人現成的數據,有種懶惰、跟隨、撿便宜的心態。」汪建所說的「心態」,是指華大一路走來,堅持解讀生命源頭,以IT的大規模資訊分析,做為生命科學支撐的發展模式。目前華大擁有一百六十多台第二代測序儀,已是全球最大的基因組研發中心。不少台灣研究者都驚訝華大發展的速度。他們陸續完成的項目包括:雜交水稻基因圖譜,《自然》譽此為「中國對世界的最大貢獻」、第一例中國人基因組序列圖譜;也破解了全球的動植物,包括熊貓、阿拉伯駱駝等基因。華大的目標,除了科學家想全面認識生命的本質,更多是著眼未來,包括透過基因增長糧食量。也包括透過個人基因圖譜,在嬰兒出生時可以知道可能的疾病,提前控制飲食、鍛鍊身體或提早治療。為成為全球最好的基因組團隊,他們走向世界,挑戰極限。○三年SARS、○四年印度洋海嘯、及汶川大地震,華大派出隊伍,找病毒株,幫屍體鑑定DNA,在災區監測微生物。這一支中國科研團隊,憑著政府大力支持,及瘋狂的科學精神,已吸引無數科學家與投資者目光。不久後,深圳市政府將支持華大,與中國農科院、國際水稻研究所、蓋茲基金會等合作,建立全球最大的農業新型育種中心。正在茁壯的華大會不會出售呢?汪建嗆了一聲,「別忘了孟山都,是拿著中國大豆,基因轉植後再傾銷中國!」汪建的夢想不是出售公司。他的夢比這大又美。他希望能給未來的中國經濟發展,打下良好的基礎

1999年成立以來,堅持「以任務帶學科、帶產業、帶人才」,先後完成了國際人類基因組計劃[2]「中國部分」(1%,承擔其中絕大部分工作)、國際人類單體型圖計劃(10%)、第一個亞洲人基因組圖譜(「炎黃一號」)、水稻基因組計劃、大熊貓基因組計劃等多項具有國際先進水平的基因組研究工作,彰顯了世界領先的測序能力和生物信息分析能力,也奠定了中國在基因組學研究領域中的國際領先地位。同時,華大基因在全球範圍內與眾多學術機構和研發企業建立了廣泛的合作關係,致力於在人類健康服務事業和科技應用領域的發展。

華大基因已經形成了科學、技術、產業相互促進的發展模式,擁有一支世界一流水平的產學研隊伍,建立了核酸測序平台、蛋白質譜平台、細胞學平台、動物克隆平台、微生物平台、動物平台、海洋生物平台、信息技術平台,並作為核心單位參與國家基因庫的構建,成立了生育健康中心和臨床及醫學健康中心,進一步促進基因組學研究成果向人類健康服務、環境應用、生物育種等方面的應用轉化。

在未來的發展中,華大基因將依託先進的測序和檢測技術、高效的信息分析能力、豐富的生物資源、以多學科結合的新型生物科研體系為基礎,為全球的科研工作者提供創新型生物研究的科技服務,推動基因組學研究在相關領域的發展;同時,為廣大普通民眾提供前沿生物科技在醫療、農業、環境等領域的應用服務,真正做到科技惠民,為中國生物經濟產業的戰略發展奠定基礎。

目錄

 

發展歷程

199999日,華大基因因參與「1%人類基因組計劃」而誕生。該計畫自1990年即已啟動,2003年完成。2002年至2005年,參與國際人類單體型圖譜計劃(中國承擔10%),2007年至2008年,參與第一個亞洲人基因組圖譜(中國承擔100%)。

2007年至2010年,中英啟動,美國參與千人基因組計劃。2009年至2010年,參與中歐合作人類腸道菌群研究。2011年起,參與百萬基因組計劃,將持續至2020年。

華大品牌

作為以領先的生物技術造福人類為宗旨的生物科技公司,華大基因憑藉自身強大的硬體平台和人才資源,為全球科研工作者提供創新型生物研究服務,為廣大普通民眾提供前沿生物科技在醫療、農業、環境等領域的應用服務。為適應不同領域的應用需要,2012年華大基因誕生六個子品牌,滿足不同領域用戶的需求。

華大基因研究院

華大基因研究院是以解決人類社會發展重大需求為目標,通過創新整合實現技術開發、科學發現和產品孵化,成為全球領先的貫穿組學研究機構。

20076月, 深圳華大基因研究院成立。20117月,華大基因大數據期刊《Giga Science》雜誌已經開始接收數據,並公開了首個可引用的資料庫—德國大腸桿菌資料庫。

華大基因科技服務有限公司

華大基因科技服務有限公司依託華大基因世界領先的大規模測序、生物信息分析、細胞克隆、健康監測、農業育種等技術平台,建立了先進的科研平台、嚴格的質量體系、標準化和個性化的數據分析以及優質的服務流程,為從事生物、農業、醫藥等生命科學領域的研究人員提供科研合作與服務。

20098月,華大基因專門成立科技合作事業部,旨在為全球合作夥伴提供科技合作和服務。20124月,華大基因科技服務有限公司正式成立,致力成為全球領先的生物科研解決方案提供者。

華大基因科技服務有限公司依託多種成熟技術平台,服務於生命科學研究的各個領域,為全球從事生命科學研究的科研人員提供高質量的、行業領先的基因組學測序服務、基因分型、轉錄組學測序服務、表觀組學測序服務、蛋白質譜分析服務、Sanger測序及Oligo合成、生物雲計算等標準化的生物技術外包服務;除此外,我們還可以依據您的個性化需求提供定製化產品服務以及一站式全套的解決方案(Total Solution)。

華大健康

華大健康依託華大基因全球領先的生物技術力量,將華大基因的科研成果延伸到臨床檢測和診斷等與健康相關的應用領域而建立的臨床醫學平台,致力於降低出生缺陷及重大疾病對人類健康的危害。

華大健康為人類提供貫穿整個生命周期的健康服務,涉及生育健康、遺傳病、血液病、病原微生物、腫瘤等領域的檢測服務。

20072月,「華大健康事業部」正式成立。20123月,臨檢中心及胎兒與生殖健康中心合併,成立深圳華大基因健康科技有限公司。

華大農業

華大農業依託華大基因全球領先的基因組測序和生物信息分析技術,將華大基因動植物研究技術與成果應用於動物、植物、微生物、海洋等領域,建立了高效基因功能驗證、分子育種技術、高效基因分型及表型鑒定、手工克隆技術公共技術服務平台,為行業提供便捷、高效的共性技術服務。

華大農業已經建成了高通量植物轉基因、全基因組分子育種、動物手工克隆及海洋生物等4個技術平台,擁有1個國家重點實驗室、1個部級重點實驗室、1個省重點實驗室以及4個深圳市重點實驗室。本部門與國際水稻研究所、國際玉米小麥改良中心、中國農科院等國內外農業機構開展深入合作,迄今在Nature系列雜誌發表農業相關論文6篇。

20097月,華大方舟生物技術有限公司成立,是世界第一家手工克隆產業化公司。2010年,農能平台、微生物平台與克隆平台整合成華大基因的生命科學事業部,暨華大農業。

華大基因學院

華大基因學院致力於培養生物領域科研和產業需要的創新型人才,建立「以項目帶學科、帶產業、帶人才」,在實戰中培養人才的新型教育培養體系,打造國際化高水平的跨組學研究型特色學院。

華大基因學院已和包括武漢大學,東南大學,華南理工大學在內的10餘所知名高校建立了教育合作關係,採用「2.5+1.5+X」或「3+1+X」的模式開展本、碩博聯合培養,同時還與香港中文大學、哥本哈根大學、奧胡斯大學、美國加州大學戴維斯分校等國際知名高校開展碩、博聯合培養計劃,探索創新人才培養方式。

201110月,深圳市華大基因學院成立。2012年,華大基因學院創新班學員在國際遺傳工程機器大賽亞洲賽區中斬獲金牌。

華大雲計算

華大雲計算依託華大基因強大的計算和存儲能力,採用世界一流的信息技術,構建了「EasyGenomicsTM」、「內部雲」、「檢測雲」「健康雲」等多個雲平台,為需要進行大數據處理的用戶提供大規模的下一代測序(Next GenerationSequencing, NGS)數據存儲和分析流程相結合的信息分析服務,解決海量數據的收集、存儲、傳輸、安全性和數據分析處理等重大難題。

2009年,雲計算部門獨立成立,支撐華大科研、業務運營。2012年,對外發布EasygenomicsTM和開發臨床檢測雲平台。

華大片區

華大基因自1999年成立以來,足跡遍布全球五十多個國家,業務覆蓋了科技、健康、農業等多個領域,致力於為全球夥伴提供先進的測序服務。

根據業務需要,華大基因在全球分布六大片區,分別為中國內地、亞太、美洲、歐洲、港澳台、日本,除在主要城市設立分部外,還有多個業務中心、代表處,各片區依託華大基因先進的測序和檢測技術、高效的信息分析能力、豐富的生物資源、多學科結合的生物科研體系,為當地的科研工作者提供創新性生物研究服務,為當地民眾提供生物科技在醫療、農業、環境等領域的應用服務。

中國內地華大

華大基因在中國內地分為華北、華南、華中、華東、西北五大片區。 秉承華大基因關注民生、科技惠民的宗旨,中國片區致力於為國內學者及科研機構提供服務,發展和民生相關的醫療檢驗技術,帶動中國內地生物技術產業及醫學健康事業的發展。

199999日,為完成「國際人類基因組計劃」,華大基因成立於北京空港工業區。20061023日,"第一屆國際基因組學大會"在杭州召開。

美洲華大

美洲華大成立於20104月,總部設在美國麻薩諸塞州的波士頓。美洲華大基於華大基因先進的測序技術,通過高質量的測序和信息分析,為美洲的科研、醫療機構提供服務,推動華大基因在基因組學領域取得更深遠的發展。

2011年底華大基因先後與美國加州大學戴維斯分校、美國費城兒童醫院簽署協議,聯合共建2個基因組學研究中心BGI@UC Davis Joint Genome CenterBGI@CHOP Joint Genome Center

2012年第一屆ICG-Americas會議成功在費城舉辦,400名來自各高校的著名學者及藥企精英就基因學界的前沿問題進行交流。

歐洲華大

歐洲華大基因成立於20105月,業務中心坐落於哥本哈根,服務覆蓋十幾個歐洲國家和地區。歐洲華大依託華大基因的資源,及歐洲實驗中心的測序平台和優秀人才,為歐洲生命科學與健康等領域的科研人員提供全方位的一站式生物技術服務和系統解決方案,為歐洲民眾的健康提供基因檢測服務。

2012年,華大基因在歐洲建立的首個基因組研究中心正式開幕。該中心位於丹麥哥本哈根生物科技園。20133月,華大基因與英國基因組分析中心正式簽署合作備忘錄,在糧食安全、能源及健康領域開展相關研究。

港澳台華大

20107, 香港華大正式成立,引入高端測序儀,旨在將該中心打造成為世界最先進的國際化基因測序中心、基因數據計算處理中心、蛋白質組學研究中心、臨床服務中心以及華大基因的國際財務中心,為全球科研工作者及合作夥伴提供生物領域相關的高品質服務。

20093月,與香港中文大學合作成立「中•華基因組研究中心」,開展了廣泛的科研合作與交流。2012316, 澳門科技大學與華大基因簽署了建立「聯合實驗室」的合作協議,致力於提高中國中醫藥科學研究的國際影響力。

亞太華大

華大基因亞太片區2010年成立,服務區域為東南亞、中東和南亞、大洋洲等地,業務內容包括醫療健康,臨床實驗,前沿科學等等,現已與片區內多家醫療機構、高等院校、第三方檢驗機構和生物公司等建立了良好的合作關係,並已開展了多項臨床檢測和臨床研究項目,取得了重要成果。

20117月,第一屆生物IT亞太會議在深圳召開。會議由華大基因(BGI)和英偉達(NVIDIA)共同舉辦。20125月,華大基因獲雪梨大學頒發合作獎,雙方共商在未來的鏽病研究中有更多的合作。

日本華大

華大基因日本片區建於2010年底,總部設立在日本的神戶市,是華大基因全球布局中繼中國、美洲、歐洲、亞太之後又一個獨立的業務區域。日本華大不僅為日本科研機構、科學研究者提供快速、優質的科技服務,同時向日本的醫療機構、健康公司提供遺傳基因檢測等人類健康方面的合作服務。

2011519日,日本華大協同日本千葉癌症中心研究院、東京醫科齒科大學等在深圳主辦第一屆中日癌症會議。2012511日,日本華大協同日本東京大學、京都大學、慶應義塾大學、農業生物資源研究所等研究機構和大學共同主辦5場研討會。

技術平台

華大基因憑藉先進的測序和檢測技術、高效的信息分析能力、豐富的生物資源,搭建了世界先進的多技術平台,可實現從中心法則到結構與功能的貫穿研究,構建生物技術與信息技術相融合的網路體系。

本著大平台、大資源的方向,華大基因目前擁有測序平台、質譜平台、信息中心、國家基因庫等技術平台、資源庫。2013年,華大基因還收購了人類全基因組精準測序的創新領導者Complete Genomics,豐富現有多種平台基礎上的基因組學研究技術,以強大的平台實力為科研工作者及大眾提供服務。   

Complete Genomics

美國Complete Genomics 是人類全基因組精準測序的創新領導者,通過領先的測序服務的模式,提供了現今最精確的人類全基因組學技術。2013318日華大基因通過其全資子公司Beta Acquisition Corporation 完成對Complete Genomics 的收購。

Complete Genomics擁有易用、高效、先進的信息及分析系統,它為更好地了解疾病的預防、診斷和治療提供了所必須的基因信息。

測序平台

新一代測序平台承載著基因測序產業的重任,它使人類進一步解讀生命奧妙成為了可能。華大基因測序平台目前主要以Illumina高通量測序平台為主,Illumina高通量測序平台主要由HiSeq測序儀和MiSeq測序儀組成。此外,還包括了羅氏454測序平台及Life公司的Ion Torrent測序平台。除測序平台之外,還有合成平台、基因分型平台、全基因酶切圖譜平台等讓測序結果更精確的輔助平台。測序涉及生物學各領域,包括DNA測序、RNA測序、宏基因組測序、甲基化測序、外顯子捕獲測序、ChIP-SeqMeDIP測序等。

質譜平台

質譜平台基於高通量質譜技術進行工業規模的蛋白質組學、代謝組學研究及目標分子檢測,已通過OHSAS18001ISO14001ISO9001質量管理體系認證。實驗室佔地2000平米,配備多台高靈敏度、高解析度、高精度的質譜儀,目前主要進行蛋白質組學和代謝組學的全譜分析、定量分析、蛋白修飾分析和目標蛋白、多肽和各種小分子的分析檢測,也可以結合目前的基因組、轉錄組數據展開貫穿性科研項目。質譜平台目前已經應用在人類染色體蛋白質組學計劃(c-HPP)、新生兒遺傳代謝檢測、耳聾基因篩查等眾多科研及產業項目中。

信息中心

信息中心以實現超大規模生物信息學計算為中心任務,不斷提升其在高效能計算、雲計算服務能力,為海量數據處理提供創新解決方案。

華大基因擁有深圳、香港、北京、武漢、杭州等數個大型生物信息學超級計算中心,總峰值計算能力達到212 T flops, 總內存容量達到35.9 TB,總存儲能力達到18.38 PB。其中位於深圳和香港的集群的峰值計算能力分列國內生物信息領域第一和第二位,有能力為海量生物信息學數據的存儲、處理和分析提供穩定而高效的資源保障。   

國家基因庫

201110月深圳國家基因庫建設方案由國家發展改革委、財政部、工業和信息化部以及衛生部四部委批覆,並由深圳華大基因研究院組建及運營。

國家基因庫集生物資源樣本庫、生物信息資料庫和生物資源信息網路為一體,通過建立高水平的生物資源樣本庫、高效的生物信息數據處理、存儲與管理系統以及覆蓋廣泛的聯盟網路,有效保護、合理開發和利用中國生物資源及基因數據資源,充分調動、發揮及整合各地區、各單位的資源和技術優勢,積極開展廣泛交流與合作,搭建信息資源研究開發的基礎性支撐平台,提高中國生命科學研究水平和國際影響力,促進中國生物產業發展。

20035月,華大基因用十幾個小時就測出了SARS病毒序列,96個小時就做出了SARS檢測試劑 酶聯免疫試劑盒,並向全國防止非典型肺炎指揮部捐贈30萬人份的SARS病毒診斷試劑盒。同年,胡錦濤主席來到北京華大訪問時,對華大基因在期間做的貢獻給予了高度的評價:「想中央之所想,急人民之所急,辦抗病之所需」。

德國大腸桿菌疫情戰役

2011527日,華大收到病菌樣本;62日,完成基因組測序並公布序列;67日,研製成功診斷試劑盒並無償公開檢測方法;728日,德國大腸桿菌的研究成果在《新英格蘭醫學》雜誌發表。

H7N9

據衛生部衛生應急辦公室201346日公布的數據,截至17時,全國共報告18例人感染H7N9禽流感確診病例,其中死亡6人。在人感染H7N9禽流感病例出現後,華大基因立即積極聯繫參與對病毒的研究,開啟應急通道,建立快速檢測平台,可在36小時內對樣本進行精確檢測。並且構建了流感及重大傳染病基因組資料庫,可及時應對各種突發公共衛生事件。

印度洋海嘯

20041230日,華大基因派出DNA鑒定救援組趕赴泰國海嘯災區,承擔了海嘯遇難人員DNA檢測的任務。當時遇難者數目龐大,鑒定DNA的工作無法實行。華大基因主動提出為泰國遇難者免費鑒定逾千份的DNA樣本。

汶川地震

2008518日至62日,華大基因地震災區疾控工作組赴四川災區參與「512汶川地震」災後重建工作,檢測可能引發的突發衛生和傳染病事件。20085月,華大基因全體員工向汶川地震受災同胞捐款獻愛心。

雅安地震

2013420日上午802分,四川省雅安市蘆山縣發生7.0級地震,災情嚴重。華大基因宣布將無償為地震災區提供包括疫情監控、應急病原微生物檢測、身份辨識、傷患治療需要的HLA配型檢測等各項技術服務,並將捐贈首批10萬人份診斷試劑用於輸血安全、病原檢測等應用。並協調好所有可能用得到的平台資源,做好了技術和人員儲備,處於24小時待命狀態,隨時組織科技救援隊伍趕往一線。   

民生

「宮頸關愛日」暨「全國百萬婦女創新型宮頸癌篩查項目」啟動

201337日,華大健康發起首個「宮頸關愛日」並啟動「全國百萬婦女創新型宮頸癌篩查項目」。

捐獻中華骨髓庫

2010年,華大基因捐助4300萬元資金協助中華骨髓庫完成9萬人份的HLA高分辨分型測序。2011125日,中國紅十字會授予深圳華大基因研究院紅十字最高榮譽-紅十字勳章。

台長: loomayorchids 台灣蔡大川
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