為了避免綠營在下午圍城活動引發事端，總統府將原本要在下午4點半舉行的馬陳會提早到上午11點舉行，消息傳出後讓民進黨一陣錯愕，由於中南部預定參加圍城的群眾尚未抵達，加上部分群眾因為昨晚晶華酒店的抗議衝突還在休息恢復元氣中，民進黨文宣部主任鄭文燦說，黨中央現在正召開緊急會議，至於民進黨籍立委在聞訊後非常憤怒，不過由於事出突然，黨團表示，一切交由黨中央決定。
為了累積圍城能量，民進黨5日特意將中常會拉到靜坐現場舉行，中常會並決定6日圍城行動，所有黨公職強制動員、全員到齊，蔡英文強調，包含法律責任的所有責任，全部都由她承擔。
台北市警局5日已依法核准民進黨1106遊行路線的更改，內政部表達尊重，並期盼參與遊行的政黨與民眾都能秉持理性守法的態度；面對民進黨打算包圍台北賓館，警方也做好萬全準備，除了調派3000名警力維持秩序，並設立兩階段交通管制及拉起兩層拒馬，防止衝突，其中更重要的是，民進黨因為有簽署不搗亂切結書，如果意外發生，警方將強制解散遊行，並將申請人移送法辦。
面對綠營圍城遊行，警方已經做好萬全準備，除了就民進黨規劃遊行的路線外圍，包括延平南路以東、衡陽路、襄陽路、忠孝東路以南、林森南路以西、愛國東西路以北先做初步的交通管制，並部署超過3000名警力維持秩序，如果衝突發生，更會將交通管制範圍擴大到中華路、忠孝東西路、杭州南路、南海路的區域，並在附近拉起拒馬，其中最敏感的台北賓館附近，更是警力部署的重點，拉起第二層防護拒馬。
陳雲林訪台／上千警力開道 陳雲林一夜驚魂
2008/11/06 09:37 社會中心／台北報導
中國海協會會長陳雲林昨晚被圍困在晶華酒店，警政署長在今天凌晨12點多調派上千鎮暴警察集結中山分局，再以步步逼進的方式強勢開道，為陳雲林清出一條路。至於陳雲林下榻的圓山飯店，昨晚也有大批民眾前往圍堵。
國民黨主席吳伯雄昨晚在晶華酒店宴請陳雲林，由於抗議民眾愈聚愈多，且圍住附近出入幹道，致使陳雲林一行被困在飯店內。警民衝突中有人掛彩，加上媒體連線報導，情緒激昂的數百民眾聚集不散，內政部長廖了以、警政署長王卓鈞徹夜坐鎮指揮，調度優勢警力逐一將狀況排除。
為了嗆聲，民進黨立委蔡同榮、葉宜津、賴清德等在昨日下午四時就先在飯店二樓「喝咖啡」，酒店門口另有抗議民眾舉牌抗議，因為綠營有備而來，使得這場晚宴在晚間9時多結束之後，因酒店兩側、林森南路，一旁的長春路等車輛出入要口都是抗議人潮，陳雲林一行被困在酒店內，海基會官員基於安全考量，一度建議陳雲林及吳伯雄留宿晶華酒店。
為了讓陳雲林安全返回圓山飯店，除了內政部長廖了以坐鎮指揮外，警政署長王卓鈞也前往中山警分局的前進指揮所，與台北市政府警察局長洪勝堃、副局長簡枝財、刑警大隊長陳檡文、交通大隊長陳銘政頻頻聯繫調動警力增援。
凌晨1時多，約1500名鎮暴警察佈署完成後，警方先以人牆阻隔南京東路、中山北路口車輛進入；凌晨1時35分，500多名鎮暴警力手持盾牌，開始向前推進，抗議民眾則是不斷衝撞，或是丟擲水瓶等物品。
在警方取得地理位置優勢之後，陳雲林凌晨2點05分在國民黨主席吳伯雄陪伴下，自晶華三樓宴會廳下樓，隨後並在優勢警力保護下自酒店側門搭車離去。而離去時，有名高喊「台灣獨立」的男子突然撲上陳雲林座車的引擎蓋上，但隨即被警方帶走。（新聞來源：東森新聞記者賴思豪、林翰廷）
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