1791年12月5日莫札特逝世。
去世3年前，他在信上講他自己。「自從我是周遊歐洲各地宮廷的小男孩時開始，一直聽到同樣的話，說我具有特別才能。我曾經蒙眼演奏，也遭遇各種各樣的試驗。這種事情，只要花較多的時間練習，很容易就辦到。我承認我比較幸運，但作曲是完全別的問題。其他沒有一個人，在這麼長久的歲月裡，像我這樣為作曲花長久時間與龐大思考的。有名大師的作品我都曾仔細研究過。作曲家是要有精神思考，與好幾個小時的努力。」
1791年，莫札特大概有預感，覺得自己的死期已近。有名的「安魂曲」傳說。在一個夏天的日子裡，穿灰色衣服的男人來找他，放下50杜卡(Dukaten)訂金委託寫一首「安魂曲」，名字也不講就回去。傭人追出去要問名字，到外面已不見人影。莫札特聽到傭人報告，認為灰色衣服的男人是冥府派來的使者，所委託的「安魂曲」是為莫札特自己的音樂。這是他遺孀康絲坦茲所傳的。又有一天，當莫札特在維也納的公園散步時，臉色蒼白的說，有人要下毒害他。這也是他遺孀傳的。
莫札特很親近海頓。海頓曾任職匈牙利艾斯特爾哈吉(Esterházy)侯爵家樂長約30年，後因侯爵去世而離開樂長職，另應倫敦的邀請赴英。莫札特聽到海頓要赴英國，受到大打擊。海頓的傳記作家波爾寫道：「莫札特擔心的說：『爸爸(莫札特經常這樣叫海頓)，您不曾知道廣大的世界，也不會講外國話』。海頓回他說：『不，我的話全世界的人都聽得懂』。不久，別離的時刻到了。海頓與莫札特無法抑制離情，都愴然落淚，莫札特還哭出聲音。他緊抱海頓，毫無遲疑地說：『爸爸，我很擔心，總覺得這次離別後，就再也不能見面了……』。馬車出發了，載著頻頻回頭的海頓，更行更遠。莫札特獨自佇立，他最好的朋友消失了──他們沒再見面」。
海頓在馬車裡，以為「這次離別後就再也不能見面」這句話，是衝著58歲的他說的，但是死亡卻先降臨到35歲的莫札特身上。海頓在倫敦滯留一年半而回到維也納時，莫札特已不在人間，原來「這次離別後就再也不能見面」也許是莫札特無意識預感自己不久人世而講的話。
莫札特跟海頓離別後，馬上開始譜寫不知什麼時候才能公開演奏的鋼琴協奏曲。當時，維也納的民眾已不再喜歡他，他的演奏會已無法舉開，因此也沒有急著寫鋼琴協奏曲的必要。這首降B大調第27號鋼琴協奏曲K595在1月5日就完成。
(MariaJoão Pires鋼琴，TrevorPinnock指揮歐洲室內管弦樂團http://youtu.be/c9gvTKdZhD4 )
5年前所寫的最美的協奏曲群第22號K482、第23號K488、K491，不吝惜驅使管樂器豐盈的音色表現出富麗的音樂。
(K482，Kristian Bezuidenhout鋼琴，Petra Müllejans指揮Freiburg Baroque Orchestra http://youtu.be/5aeLhUEfejg)
(K488，Daniil Trifonov鋼琴，Avner Biron指揮Israel Camerata Orchestra http://youtu.be/-s68kHOnpiE )
(K491，André Previn鋼琴並指揮RoyalPhilharmonic Orchestra http://youtu.be/zTsdfyE9jBg)
而在1791年完成的最後一首鋼琴協奏曲，竟洗盡所有顏色，像淡彩的水墨畫，淡淡勾出音樂。
10天後，莫札特使用此曲第3樂章的旋律寫一首童謠賣給出版社，曲名是「嚮往春天」K596。如果降B大調第27號鋼琴協奏曲的終樂章是「嚮往春天」，那打動聽者心靈的這首第27號鋼琴協奏曲中枯寂的世界，該是冬天的音樂。那是已經不奢望自己再有春天的男人，在死亡預感下所寫的音樂。流在這音樂基底的，是跟海頓分別時所說的那句「這次離別後就再也不能見面」的話。
以這首鋼琴協奏曲為轉捩點，此後到去世為止所寫的音樂，其內容與以前所寫的音樂大異其趣。這些音樂都顯得輕飄飄的曲趣，好像已甩脫這人間的累贅。幾首舞曲、歌劇「魔笛」、「聖體頌」(Ave verum corpus)、單簧管協奏曲等作品，都以共通的色彩形成「1791年的音樂」。其中作響的已不是現世的聲音。
(歌劇「魔笛」，Colin Davis指揮高文皇家歌劇院管弦樂團等，http://youtu.be/MP-o-hBTelI)
(「聖體頌」，伯恩斯坦指揮巴伐利亞廣播交響樂團與合唱團，http://youtu.be/6KUDs8KJc_c)
(單簧管協奏曲，Nadja Drakslar 單簧管，http://youtu.be/_0mIhjhUnjQ )
反觀現世，他所處的環境已很惡劣。他的魅力在5年前就已不存在，而宮廷中瀰滿反莫札特的氣息。他那滿口髒話的習慣，舉止毫無分寸，無意識中傷到別人的行為，都讓他在無形中樹立敵人。而且，他們夫妻都少經濟觀念，因此一旦開不成演奏會，生活馬上發生困難，最後的3年，到處告貸。支持他的，只有皇帝約瑟二世與馮‧斯威廷男爵。皇帝任命他為宮廷作曲家，這個職位一般都有2000盾（gulden）年俸，但他只得800盾。原來宮廷劇場監督官忌妒莫札特受寵，故意減俸。
約瑟二世於1790年去世，承繼帝位的是他弟弟利奧波德二世，他沒有哥哥的文學性，因而對莫札特的特別待遇也中斷。曾寫「費加洛的婚禮」、「喬望尼先生」劇本的宮廷詩人達‧彭特還繼續支持莫札特，但是達‧彭特與宮廷樂長薩利艾里(Antonio Salieri，1750-1825)因女人而發生問題，到1791年春天，他也被驅出維也納，莫札特幾乎是孤立無援。莫札特沒有承奉別人的能耐，因此朋友都是一些開開玩笑唱唱歌，心無城府的人，沒有一個有辦法讓他出頭。
早些時候，莫札特就知道他已不在大眾的心裡佔有地位，因此也考慮過易地求職。1789年曾到柏林的宮廷求發展，結果只接到一首弦樂四重奏與一首「容易演奏的」鋼琴奏鳴曲的訂作。(後來他也沒有寫這些作品就去世。也有莫札特傳記作家認為，這很可能只是莫札特胡謅一番)。
1790年利奧波德二世在法蘭克福加冕，莫札特自費前往。神聖羅馬帝國中的王侯貴族會雲集到那兒，莫札特自忖，如果為這些人開音樂會，那一定會名噪一時，也會有收入，運氣好的話，也許還能得到一官半職。法蘭克福曾經是瘋狂迎接只有7歲的神童莫札特的城市。當時連夜舉辦音樂會，每一場都客滿，聽眾裡還有當時14歲的少年歌德。27年前的舊事……！但是這一次？沒有人要來聽他的演奏。他嚐到空前的挫折感與羞辱。從前在凡爾賽宮、白金漢宮、美泉宮等宮殿裡，在水晶燈下受到滿堂喝采，被榮耀包圍的天才少年不復存在。他邊哭邊寫信給妻子說：
「10月17日在美因茲
寫這封信時，眼淚一滴又一滴滴下來。但是還是要打起精神來。…抓住…有許多吻在飛來飛去…好像成隊在飛，哈哈哈，抓到了3個……」
他到這個地步，還不忘開玩笑。但在法蘭克福徹底的失敗，一定使他感覺到人生的冷熱無常。回到維也納，送走海頓後，莫札特不覺流下眼淚。
或許是不久於人世的預感，促使莫札特開始兌現以前對朋友所做的承諾。1791年4月12日，先完成弦樂五重奏曲K. 614，(Quartetto Stradivari 演奏， http://youtu.be/oEp1M98Hhuo )，初版的樂譜首頁，書明是「為某匈牙利朋友所作」。
其次為席卡尼達劇團寫不一定有收入的歌劇大作「魔笛」。在11年前，在薩爾茲堡認識這劇團的團長席卡尼達（EmanuelSchikaneder），席卡尼達常要莫札特寫首詠唱調，或是寫一齣歌劇，莫札特一直沒有為這劇團寫。3年前，席卡尼達在維也納郊外開設小劇場，又開始吵莫札特為他寫一齣歌劇。莫札特在這兩年之間，一直提不起精神寫歌劇，但最後一年春天，席卡尼達帶來「魔笛」劇本，他就一口答應。他對這個長年的朋友沒寫過什麼作品，這次好像償還了久年的人情債。他也順便為劇團的男低音格嚕嚕寫首詠唱調「為了這美麗的手與眼睛」K.612(3月8日)( http://youtu.be/jWfbX3Nkbn4 )。格嚕嚕也是一直央求他寫詠唱調的朋友。
6月，妻子康絲坦茲要到巴登療養身體，莫札特寫信給親友合唱指揮安東‧舒特爾，麻煩他安排康絲坦茲的住宿。舒特爾每次都幫莫札特安排康絲坦茲的住宿，這個朋友也在很久以前就央求他寫聖歌隊用的合唱曲。莫札特想起這事，在6月17日，寫了一首很短的經文歌給舒特爾。這就是經文歌「聖體頌」K.618。這首異常透明如碧空的珠玉般小品，至今還發不滅的光芒，表示著他為朋友的心意。
8月初，莫札特從布拉格接到為神聖羅馬帝國皇帝利奧波德二世的加冕創作歌劇「狄托的仁慈」K.621的工作，就跟單簧管手史塔特勒一道前往布拉格。在晚年，唯有這個朋友向經濟拮据的莫札特告貸，莫札特也不顧自己也不夠用，還予以救濟，或借錢給他。其金額竟達他年俸的三分之二！雖然史塔特勒的人品不好，但他有演奏單簧管的天才，莫札特喜歡他這一點，認識他以後，常常為他寫一些樂曲。「狄托的仁慈」中也特地寫須由單簧管獨奏陪伴的詠唱調，更帶他到布拉格表示他最後的友情。而史塔特勒還抱怨說，莫札特答應他寫一首單簧管協奏曲，過了兩年都還沒完成。
莫札特的確在兩年前就開始為史塔特勒寫協奏曲，但只寫到第1樂章的中途就停下來。當時寫的是史塔特勒喜歡的巴塞管協奏曲。莫札特從布拉格回來後，先完成「魔笛」，9月30日首演後，鼓起最後的體力，為史塔特勒把巴塞管協奏曲改為單簧管協奏曲繼續完成。其第2樂章已讓聽者覺得非人間的音樂。
人情債沒了嗎？還有一個。天天見面，不催他，人很好的法國號手萊特給普(JosephLeitgeb，1732-1811)。兩人認識時，萊特給普31歲，莫札特7歲，萊特給普大莫札特24歲，兩人卻有30年交情。莫札特為萊特給普寫一首法國號協奏曲，只寫到第1樂章中途就擱置在那兒。莫札特對親密的朋友喜歡用髒話開玩笑，很多時候，這種髒話玩笑還不限於朋友而隨便亂開。寫信也一樣，甚至大開黃腔。這也是他後來不得人緣的原因之一。但萊特給普容忍他的這種壞習慣。他還看得出來那些髒話的背後所隱藏的親密感情。
莫札特知道自己的體力所剩不多，就為「可憐的萊特給普大笨蛋」趕寫法國號協奏曲。先修改第1樂章的一部分，加尾聲與管樂部分，以完成第1樂章。接著寫第2樂章。先寫主要部分，完成135小節的草稿。然後回到前面，寫到40小節處，他再也寫不下去。
這首作品與「安魂曲」並行譜寫，到這時候莫札特知道這又是一首無法完成的曲子，就在第2樂章法國號獨奏的樂譜上面寫下無法完成的歉意，還寫對這長年的好友告別的話。他的愛情，經常以髒話與玩笑表現(當時的德國南部，在親友間常以髒話開玩笑而不算是禁忌)。「吹得好，吹得差勁…糟老頭…夠了，太無聊了…」萊特給普在莫札特去世後，看到這些文字。30年的交情，知道莫札特想說的是「老頭兒，演奏技術還不錯嘛。身體還好吧。我不行了，只能寫到這兒。抱歉了，再見。」萊特給普知道，在莫札特輕佻外觀之下，隱藏的真實。而且這小伙子，拖著疲憊不堪的身體，還想為他完成早時候承諾的作品呢。
這首法國號協奏曲由後人編為第1號，補完第2樂章的，很可能又是補完「安魂曲」的蘇斯邁爾（Franz XavierSüssmayer）。補得很差。但對萊特給普來說，這已經沒有什麼關係，因為他不想在親友去世後，演奏他的作品撈點錢。事實上，也沒有他演奏此曲的紀錄。萊特給普接到蘇斯邁爾補完第2樂章的法國號協奏曲D大調的樂譜後，一看就知道補得太差，但他沒說什麼。他看到第2樂章法國號獨奏譜上面莫札特寫的字，完全知道莫札特的愛情。他自語，「從來不曾有那麼傑出的男人」。萊特給普把蘇斯邁爾的樂譜擱在一邊，只把莫札特的手稿部分封存在金庫裡。這是那小伙子送給他的禮物，並不需要吹給別人聽。
莫札特的葬禮日期有兩個說法，一個是12月6日舉行，一個是12月7日舉行。遺體埋在維也納郊外聖馬克墓地的共同墓穴。誰都不許隨靈車同行，因此實際埋葬的位置不清楚。
